digitalmicrograph是一款電子顯微鏡輔助軟件，主要用于透射電鏡的數(shù)據(jù)采集和分析；在生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域，電子顯微鏡(電鏡)的應(yīng)用是非常廣泛的，它比常規(guī)光學(xué)顯微鏡在放大倍數(shù)和清晰度上增強(qiáng)了1萬倍以上，是現(xiàn)代醫(yī)學(xué)必不可少的工具；有了電子顯微鏡，必須要有相關(guān)的軟件搭配，今天小編帶來的digitalmicrograph就是其中之一，這款由Gatan公司開發(fā)的軟件，支持圖像采集、圖像處理和數(shù)據(jù)分析，能夠?qū)δ繕?biāo)物進(jìn)行更準(zhǔn)確的生物定位、化學(xué)研究，同時還能對分析報告進(jìn)行打印，適用于醫(yī)生、化學(xué)家、生物工程從業(yè)者，本站提供digitalmicrograph免費(fèi)下載，有需要的趕快試試吧！

功能特色

　　1、操作簡單，軟件集成了使用說明和步驟提示，

　　2、適用范圍廣，支持生物學(xué)、醫(yī)學(xué)、化學(xué)和一切有電鏡的場合，

　　3、支持圖像采集、處理和分析，

　　4、支持分析報告打印功能，

　　5、軟件終身免費(fèi)適用和升級。

安裝方法

　　1、下載并解壓，雙擊“digitalmicrograph下載地址 密碼xm89”快捷方式進(jìn)入網(wǎng)盤，

　　2、下載“digitalmicrograph下載.rar”壓縮包，請注意是下載完整壓縮包，千萬不要在線解壓，

　　3、解壓“digitalmicrograph下載.rar”后通常包含以下文件，

　　4、首先需要先安裝licences，雙擊licenses文件夾，打開后雙擊 licenseinstall.exe，如圖，

　　5、這里單擊“install licenses”，

　　6、當(dāng)出現(xiàn)如下圖示說明，licenses安裝完成，

　　7、接下來我們需要安裝主程序，首先打開GMS_1_8_3文件夾，雙擊setup.exe，

　　8、出現(xiàn)如下界面我們選擇“next”，

　　9、一直“next”，直到出現(xiàn)許可界面，這里選擇同意，即“I accept.........”，

　　10、接下來，需要輸入我們的信息，按要求輸入即可了，

　　11、這里注意，因為本機(jī)沒有鏈接透射電鏡，所以這里一定要選擇離線，即第二個選項，（off-line），然后NEXT，

　　12、這里也需要注意第二個選項，同上我們只是在普通電腦上安裝，所以第二相我們要選擇off，即選擇support packages 的this feature will not be ................接著NEXT，

　　13、選擇好后確認(rèn)狀態(tài)如圖所示，繼續(xù)NEXT，

　　14、軟件繼續(xù)安裝，此時我們看到如下安裝界面，則表示大功告成。

使用方法

　　DigitalMicrograph 工作環(huán)境界面

　　(DM Menu) 菜單（黑框）：多種操作指令按照其功能分類。

　　(DM Tool) 工具（紅框）：這些可移動窗口包括標(biāo)準(zhǔn)工具以及多種與被顯示圖像有關(guān)的信息。

　　(Image) 圖像（藍(lán)框）： 圖像在 DM 軟件里被顯示的位置。

　　(Results) 結(jié)果（黃框）： 這個文字窗口包含 DM 軟件在運(yùn)行中的一些輸出信息。比如圖像分 析和測量的結(jié)果。窗口里面的文字可以被拷貝或以文件格式存儲。

　　(Save) 存儲（紫框）：顯示一些信息以及快速存儲、打印、設(shè)置等。

　　當(dāng)然，大家可以根據(jù)自己的習(xí)慣任意拖動工具欄快捷方式的位置來進(jìn)行調(diào)整。

　　當(dāng)不小心刪除了快捷工具時，可以點(diǎn)擊菜單欄中的Window，在下拉菜單中選擇Basic Tools，然后點(diǎn)擊Show All 即可。

　　同理，適用于顯示 Results 等功能的復(fù)位。

　　1. 圖像的亮度與襯度

　　圖像亮度與襯度的調(diào)節(jié)是保證圖像質(zhì)量的重要一環(huán)。簡言之，圖像亮度與襯度的調(diào)節(jié)實際上就是改變上述圖像與顯示器的相互關(guān)系。 DM 可以很容易地對圖像的亮度和襯度進(jìn)行調(diào)節(jié)。為了更好地說明 DM 調(diào)節(jié)亮度和襯度的原理，我們首先講解一下計 算機(jī)屏幕顯示的原理。一般來講，屏幕顯示器的灰度為8位（黑白）24位（彩色）。Gatan 數(shù)碼相機(jī)最低是12位（最高16位）。一個12 位的數(shù)字圖像含有 4096 個強(qiáng)度 值。屏幕顯示器的灰度分辨率為 256（8位）。因為圖像的強(qiáng)度分辨率大于顯示器的灰 度級別，所以我們必須首先確定怎樣使用有限的顯示器灰度來顯示圖像中更高數(shù)目的強(qiáng)度。換句話說，我們可以在圖像中任選兩個強(qiáng)度值，指定較低的強(qiáng)度為屏幕顯示器。

　　操作步驟：

　　我們可以通過快捷工具欄中的 Display Control 使用亮度和襯度劃尺來優(yōu)化圖像的顯示。

　　小技巧：雙擊”Contrast”或”Brightness”或“Gamma”文字（下圖紅色框中）可以復(fù)原亮度或襯度的初值。

　　強(qiáng)度直方圖”Histogram”窗口（如左），用鼠標(biāo)選擇位于右邊的強(qiáng)度峰（點(diǎn)擊峰的 左端，按下鼠標(biāo)并拖至峰的右端）。這個操作改變了上面提到的圖像與顯示器之間的 相互關(guān)系。從而改變了圖像的顯示。

　　小技巧：雙擊直方圖窗口下端的灰度橫帶（下圖紅框中）可以復(fù)原直方圖的初始顯示值。

　　強(qiáng)度直方圖窗口中的曲線稱為“襯度變換曲線”（它就是我們上面提到的圖像與顯示 器之間的強(qiáng)度對應(yīng)關(guān)系）。在線性模式里，它是一條直線。在”gamma”顯示模式中， 它變?yōu)榉蔷€性關(guān)系。此外通過選擇 Image Display（也可以通過快捷鍵Ctrl+D），也可以把線性模式變?yōu)榉蔷€性。

　　操作步驟如下：

　　在圖像顯示的對話窗口中，用鼠標(biāo)點(diǎn)擊襯度(Contrast)。然后在其右面的模式 (Mode)選擇項中，選取均勻化(Equalized)。最后點(diǎn)擊 OK 退出。用劃尺調(diào)節(jié)亮度或襯度，并觀察圖像的變化。此時強(qiáng)度直方圖中的曲線已經(jīng)不再是直線了?，F(xiàn)在我們再回到原先的線性模式(Image Display, 選擇 Linear mode). 在考察(survey)設(shè)定選擇中，練習(xí)選擇 cross-wire。用鼠標(biāo)選擇自動考察(AutoSurvey)。然后用鼠標(biāo)點(diǎn)擊 存儲鍵(Save Defaults)。點(diǎn)擊 OK。

　　2．彩色顯示（偽色）

　　一般來說，電子顯微鏡圖像應(yīng)該用黑白模式顯示。但有的時候有必要用偽彩來特別突 出圖像中的某些細(xì)節(jié)，或者增加一些顯示的特殊效果。在用偽彩顯示時，屏幕顯示器 的 256 個灰度（ 8 數(shù)位）同一個彩色配置表建立一一對應(yīng)關(guān)系，從而將一幅黑白圖像 轉(zhuǎn)換成彩色圖像。

　　操作步驟如下：

　　在 Object 菜單下，選擇 Image Display（也可以通過快捷鍵Ctrl+D） 在左面直框內(nèi)（下圖）Display下，選擇彩色(Color)。在彩色配置表(Color Table)下，選擇彩虹(Rainbow)，點(diǎn)擊 OK 退出。此時圖像在偽彩模式下顯示。下圖中的彩色方塊矩陣就是上面所說的黑白-彩色配置表。 用亮度或襯度劃尺來改變圖像的顯示效果。

　　再回到圖像顯示(Image Displa).選擇彩色(Color)。在彩色配置表(Color Table)下，選 擇溫度(Temperature)，點(diǎn)擊 OK 退出。注意現(xiàn)在的彩色方塊矩陣（黑白-彩色配置表） 已經(jīng)變了。點(diǎn)擊 OK 退出。

　　3．圖像注釋

　　圖像注釋通常包括在圖像中加入一些文字說明， 箭頭標(biāo)記，和其他幾何圖形(例如， 長方或圓形等等)。 DM 軟件里有很多這方面的功能可供大家選用。圖像注釋使用的工具可以在標(biāo)準(zhǔn)工具盤（Standard Tool通常位于 DM 軟件窗口的左上角）上面找到。（下圖紅框內(nèi)）

　　文字加入

　　首先用鼠標(biāo)點(diǎn)擊“文字注釋”圖標(biāo)（上圖中 A 圖標(biāo)）。然后點(diǎn)擊圖像中的任何一點(diǎn)， 此時出現(xiàn)一條豎直短線，鍵入所需要的文字。再用鼠標(biāo)點(diǎn)擊圖像中的一點(diǎn)即可終止文字輸入模式(豎直短線消失)。用鼠標(biāo)點(diǎn)擊剛剛輸入的文字，按下并移動鼠標(biāo)即可改變文字在圖像中的位置。

　　改變字形　 用鼠標(biāo)點(diǎn)擊選擇圖像中的文字（文字塊的四角變?yōu)榫G色）。然后在物體（Object）菜單下，選擇字形(Text Font)。

　　改變字體大小　 同上。在物體（Object）菜單下，選擇字體大小(Text Size)。 改變字體類型 同上。在物體（Object）菜單下，選擇字體類型(Text Style)。

　　改變字體背景 　同上。在物體（Object）菜單下，選擇字體背景(Background)。

　　畫線段和箭頭 　用鼠標(biāo)點(diǎn)擊“線段”圖標(biāo)（文字圖標(biāo)右側(cè)）。選擇圖像中的任何一點(diǎn)，按下并移動鼠 標(biāo)即可任意在圖像中畫線。 釋放鼠標(biāo)，即終止畫線模式。在畫線時，同時按下鍵盤上的移動鍵 “Shift”，可以把直線的方向限制在 0, 45, 和 90 度。在畫線時，如果同時按下鍵盤上的“Alt”鍵 , 可以把直線變成單箭頭線。如果同時按下鍵盤上的控制“Cltr”鍵, 直線變成雙箭頭線。

　　畫矩形或方形

　　用鼠標(biāo)點(diǎn)擊“方形”圖標(biāo)。選擇圖像中的任何一點(diǎn)，按下并移動鼠標(biāo)即可在圖像中畫 出任意的矩形。 釋放鼠標(biāo)，即終止模式。 在畫矩形時，如果同時按下鍵盤上的移動鍵 “Shift”，矩形變?yōu)檎叫巍?/p>

　　改變矩形或方形的類型

　　同上，首先用鼠標(biāo)單擊圖像中矩形的任何一個邊（此時圖形的四個端點(diǎn)變?yōu)榫G色）。 在物體（Object）菜單下，選擇背景(Object -> Background)。DM 軟件里一共有四種不 同的背景可供選擇。

　　畫橢圓形或園形

　　用鼠標(biāo)點(diǎn)擊“園形”圖標(biāo)。選擇圖像中的任何一點(diǎn)為橢圓或圓的中心，按下并移動鼠 標(biāo)即可在圖像中畫出任意的橢圓圖形。 釋放鼠標(biāo)，即終止模式。 在畫橢圓時，如果同時按下鍵盤上的移動鍵 “Shift”，橢圓變?yōu)閳@形。 改變橢圓的類型 類似直線和方形，先用鼠標(biāo)點(diǎn)擊圖像中的橢圓或園形（此時在圖形的四周出現(xiàn)四個綠 色端點(diǎn)）。在物體（ Object）菜單下，選擇背景(Object -> Background)。

　　4．注釋物體的規(guī)則排列

　　圖像中的各種注釋物體（例如文字，或幾何圖形，例如線段，方形，園形，等等）， 經(jīng)常有必要將它們做有規(guī)則的排列。 在DM軟件中可以將這些注釋物體按水平中心 線，豎直中心線，或中心點(diǎn)排列。

　　操作步驟如下：

　　用鼠標(biāo)選擇所有的注釋物體（按下鼠標(biāo)畫一個虛設(shè)的方形區(qū)來包圍所有的注釋物體， 或按下移動鍵“ Shift”, 用鼠標(biāo)點(diǎn)擊來選擇每個注釋物體）。被選擇后的注釋物體，端 點(diǎn)變?yōu)榫G色。在物體（Object）菜單下，選擇排列(Object -> Align)的類型。

　　5．注釋物體合并

　　如果圖像中有很多的注釋物體，在規(guī)則排列做完后，為了便于保持它們之間的排列關(guān) 系，最好將這些注釋物體合并變成一個綜合注釋物體。反過來也可以把一個綜合注釋 物體拆成許多原始的注釋物體。用鼠標(biāo)選擇所有的注釋物體，在物體（Object）菜單下，選擇合并(Object -> Group)。

　　6．圖像剪裁

　　在 DM 軟件中可以非常容易地把圖像中的重要部分剪裁出來，并在一個新的圖像窗口中顯示。 具體步驟如下： 在計算機(jī)桌面的文件夾(Gatan School)里，打開任何一張圖像。 使用“矩形區(qū)域選擇工具” (ROI 工具塊中的虛線矩形圖標(biāo)，見下圖) 在圖像中選擇要 裁剪的區(qū)域 (在預(yù)選區(qū)域的左上角點(diǎn)擊并按下鼠標(biāo)。移動鼠標(biāo)至區(qū)域的右下角。釋放 鼠標(biāo)。此時，選擇的區(qū)域被一個虛線矩形框標(biāo)出。 同時按下鍵盤上的 “Ctrl” 和字母 C 鍵?？截愡x擇區(qū)域。

　?。?　圖像顯示的坐標(biāo)系

　　數(shù)字圖像的基本單元叫做像素。圖像中每一點(diǎn)和該點(diǎn)上的強(qiáng)度由像素坐標(biāo)(x,y) 以及強(qiáng) 度值 I(x,y) 來表示。在 DM 軟件中，如果鼠標(biāo)在被顯示的圖像內(nèi)移動時，鼠標(biāo)所在的 像素位置(x,y) 以及該點(diǎn)的強(qiáng)度值 I(x,y) 可以很容易地在”圖像狀態(tài)” (Image Status)窗口中讀出(見下圖)。

　?。?圖像的儲存格式

　　DM 軟件支持多種標(biāo)準(zhǔn)圖像儲存格式。如果沒有做特別設(shè)定，圖像的默認(rèn)儲存格式為 Gatan 特殊格式（.dm3）。與其它格式不同之處在于用 Gatan特殊格式存儲的圖像只能用 DM 軟件打開。其他的標(biāo)準(zhǔn)商用軟件(比如，Photoshop) 不能直接閱讀 Gatan 特殊存儲格式。所以打不開用 Gatan 特殊格式存儲的圖像。如果大家需要使用其它的格式來存儲圖像時，比如， TIFF 或 JPEG, 需要特別加以注意。